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生物化學(xué)家發(fā)現(xiàn)了基因組組織如何影響細(xì)胞命運(yùn)的機(jī)制

時(shí)間:2022-04-29 18:38:39 來源: cnBeta.COM


當(dāng)干細(xì)胞分裂時(shí),它們具有自我更新的非凡潛力--即自我復(fù)制--或發(fā)展成特定的系。由加州大學(xué)河濱分校的生物化學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的研究小組的研究則提高了人們對干細(xì)胞每次分裂時(shí)如何保持獨(dú)特的血統(tǒng)身份的理解。

由生物化學(xué)系助理教授Sihem Cheloufi和Jernej Murn領(lǐng)導(dǎo)的研究顯示,一種名為染色質(zhì)組裝因子-1(CAF-1)的蛋白質(zhì)復(fù)合物如何控制基因組組織以維持血統(tǒng)的忠實(shí)度。該報(bào)告將于當(dāng)?shù)貢r(shí)間4月29日發(fā)表在《Nature Communications》上。

每次細(xì)胞分裂時(shí),它必須創(chuàng)建一個(gè)其基因組的副本--不僅是其DNA序列而且是DNA如何跟蛋白質(zhì)一起被包裝成染色質(zhì)。染色質(zhì)被組織成基因組位點(diǎn),這些位點(diǎn)要么是開放的、容易進(jìn)入的要么是更密集的、不易進(jìn)入的。

Cheloufi表示:“不同細(xì)胞的身份在很大程度上依賴于更開放的基因組位點(diǎn),因?yàn)橹挥形挥谶@些區(qū)域的基因才有可能被表達(dá)并轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)。”

另外,她補(bǔ)充道,為了在細(xì)胞分裂過程中保持細(xì)胞的特性,開放和封閉染色質(zhì)的位置或“染色質(zhì)組織”必須忠實(shí)地傳遞到基因組的新副本上,這項(xiàng)任務(wù)則主要委托給CAF-1。

Cheloufi說道:“為了幫助CAF-1在細(xì)胞分裂期間確保正確的染色質(zhì)組織,大量的轉(zhuǎn)錄因子以DNA序列特異性的方式被吸引到開放區(qū)域以作為書簽并招募轉(zhuǎn)錄機(jī)器來糾正線粒體的特定基因,進(jìn)而確保它們的表達(dá)。我們想知道CAF-1在多大程度上需要在細(xì)胞分裂期間維持細(xì)胞特異性染色質(zhì)組織。”

研究人員們以未成熟的血細(xì)胞作為研究范本,這些血細(xì)胞可以自我更新或變成中性粒細(xì)胞。中性粒細(xì)胞是不分裂的細(xì)胞,是我們身體對病原體的第一道防線。耐人尋味的是,他們發(fā)現(xiàn)CAF-1不僅對維持這些未成熟血細(xì)胞的自我更新至關(guān)重要,而且對保持它們的血統(tǒng)特征也至關(guān)重要。即使是CAF-1水平的適度降低,也會導(dǎo)致細(xì)胞忘記自己的身份并采用混合系階段。

Cheloufi指出:“缺少CAF-1的中性粒細(xì)胞變得更具可塑性,共同表達(dá)來自不同血統(tǒng)的基因,其中包括紅細(xì)胞和血小板的基因。從發(fā)育生物學(xué)的角度來看,這非常耐人尋味。”

在分子水平上,研究小組發(fā)現(xiàn)CAF-1通常使特定的基因組位點(diǎn)被壓實(shí)并且不能被特定的轉(zhuǎn)錄因子接觸到,尤其是一種叫做ELF1的轉(zhuǎn)錄因子。

Murn說道:“通過觀察染色質(zhì)組織,我們發(fā)現(xiàn)有一大堆基因組位點(diǎn)異常開放并因CAF-1損失而吸引ELF1。我們的研究進(jìn)一步指出了ELF1在確定幾個(gè)血細(xì)胞系的命運(yùn)中的關(guān)鍵作用。”

UCR的研究人員使用了來自小鼠骨髓的未成熟血細(xì)胞并在組織培養(yǎng)中進(jìn)行了工程化生長。他們在跟辛辛那提兒童醫(yī)院醫(yī)療中心的血液學(xué)專家、該研究的共同通訊作者Andrew Volk的合作過程中使用了一個(gè)小鼠模型并在其體內(nèi)驗(yàn)證了他們的發(fā)現(xiàn)。

接下來,Cheloufi和她的同事希望了解CAF-1在特定部位保存染色質(zhì)狀態(tài)的機(jī)制及這一過程是否在不同的細(xì)胞類型中以不同方式發(fā)揮作用。

“就像一座城市,基因組有它的景觀,有特定的地標(biāo)。了解CAF-1和其他分子如何精確地維持基因組的‘天際線’將是有趣的。解決這個(gè)問題還可以幫助我們了解如何以預(yù)測的方式操縱細(xì)胞的命運(yùn)。鑒于CAF-1在DNA復(fù)制過程中包裝基因組的基本作用,我們預(yù)計(jì)它將作為細(xì)胞身份的一般守門員。這原則上將適用于眾多組織中的所有分裂細(xì)胞,如腸道、皮膚、骨髓甚至大腦的細(xì)胞,”Cheloufi說道。


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